MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 3475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009928	C	6	6	36443	36448	0 %	0 %	0 %	100 %	158340489
502	NC_009928	GGC	2	6	36470	36475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340489
503	NC_009928	GTT	2	6	36641	36646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340489
504	NC_009928	TTC	2	6	36663	36668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340489
505	NC_009928	TTC	2	6	36671	36676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340489
506	NC_009928	GGC	2	6	36716	36721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340489
507	NC_009928	GCA	2	6	36793	36798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340489
508	NC_009928	CAG	2	6	36988	36993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340489
509	NC_009928	ACT	2	6	37050	37055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340489
510	NC_009928	GTC	2	6	37076	37081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340489
511	NC_009928	CT	3	6	37110	37115	0 %	50 %	0 %	50 %	158340489
512	NC_009928	GGC	2	6	37235	37240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340489
513	NC_009928	AGG	2	6	37407	37412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340489
514	NC_009928	GGT	2	6	37481	37486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340489
515	NC_009928	TCT	2	6	37597	37602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340489
516	NC_009928	GCT	2	6	37618	37623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340489
517	NC_009928	TC	3	6	37690	37695	0 %	50 %	0 %	50 %	158340489
518	NC_009928	GATGGA	2	12	37708	37719	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158340489
519	NC_009928	TTCAAA	2	12	37736	37747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158340489
520	NC_009928	GTCT	2	8	37796	37803	0 %	50 %	25 %	25 %	158340489
521	NC_009928	CGT	2	6	37871	37876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340489
522	NC_009928	ACCC	2	8	37883	37890	25 %	0 %	0 %	75 %	158340489
523	NC_009928	CTG	2	6	37898	37903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340489
524	NC_009928	ATG	2	6	37929	37934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340489
525	NC_009928	ACCC	2	8	38000	38007	25 %	0 %	0 %	75 %	158340489
526	NC_009928	GATG	2	8	38018	38025	25 %	25 %	50 %	0 %	158340489
527	NC_009928	ATCATG	2	12	38160	38171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158340490
528	NC_009928	GAT	2	6	38174	38179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340490
529	NC_009928	CAC	2	6	38195	38200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340490
530	NC_009928	ATG	2	6	38231	38236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340490
531	NC_009928	CAGC	2	8	38300	38307	25 %	0 %	25 %	50 %	158340490
532	NC_009928	GA	3	6	38561	38566	50 %	0 %	50 %	0 %	158340490
533	NC_009928	GAT	2	6	38603	38608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340490
534	NC_009928	ACC	2	6	38629	38634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340490
535	NC_009928	T	6	6	38650	38655	0 %	100 %	0 %	0 %	158340490
536	NC_009928	GA	3	6	38757	38762	50 %	0 %	50 %	0 %	158340491
537	NC_009928	TGC	2	6	38776	38781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340491
538	NC_009928	GA	3	6	38846	38851	50 %	0 %	50 %	0 %	158340491
539	NC_009928	TCG	2	6	38998	39003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340491
540	NC_009928	AGG	2	6	39007	39012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340491
541	NC_009928	TGA	2	6	39089	39094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340491
542	NC_009928	GGT	2	6	39110	39115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340491
543	NC_009928	GGGT	2	8	39168	39175	0 %	25 %	75 %	0 %	158340491
544	NC_009928	GAG	2	6	39239	39244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340491
545	NC_009928	TCG	2	6	39276	39281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340491
546	NC_009928	TCT	2	6	39318	39323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340491
547	NC_009928	TTGGGG	2	12	39328	39339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340491
548	NC_009928	AGC	2	6	39476	39481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340491
549	NC_009928	GGC	2	6	39502	39507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340491
550	NC_009928	CTG	2	6	39547	39552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340491
551	NC_009928	CTC	2	6	39579	39584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340491
552	NC_009928	GTT	2	6	39591	39596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340491
553	NC_009928	TCG	2	6	39648	39653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340491
554	NC_009928	CTG	2	6	40013	40018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340491
555	NC_009928	GCCAA	2	10	40082	40091	40 %	0 %	20 %	40 %	158340491
556	NC_009928	GAG	2	6	40108	40113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340491
557	NC_009928	TTTGTC	2	12	40175	40186	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158340491
558	NC_009928	TTC	2	6	40222	40227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340491
559	NC_009928	ATC	2	6	40228	40233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340491
560	NC_009928	CAT	2	6	40248	40253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340491
561	NC_009928	AT	3	6	40319	40324	50 %	50 %	0 %	0 %	158340491
562	NC_009928	T	6	6	40417	40422	0 %	100 %	0 %	0 %	158340491
563	NC_009928	AT	3	6	40472	40477	50 %	50 %	0 %	0 %	158340491
564	NC_009928	CAT	2	6	40587	40592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340491
565	NC_009928	CCA	2	6	40626	40631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340491
566	NC_009928	ATC	2	6	40646	40651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340491
567	NC_009928	GTC	2	6	40802	40807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340491
568	NC_009928	ACCAAT	2	12	41358	41369	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158340493
569	NC_009928	TCT	2	6	41375	41380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340493
570	NC_009928	CCA	2	6	41443	41448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340493
571	NC_009928	TCC	2	6	41636	41641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340493
572	NC_009928	ATCC	2	8	41719	41726	25 %	25 %	0 %	50 %	158340493
573	NC_009928	GTC	2	6	41764	41769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340493
574	NC_009928	TTG	2	6	41854	41859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340493
575	NC_009928	GAT	2	6	41886	41891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340493
576	NC_009928	ATCCAA	2	12	41968	41979	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158340493
577	NC_009928	GTT	2	6	42189	42194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340493
578	NC_009928	GAG	2	6	42235	42240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340493
579	NC_009928	AGC	2	6	42367	42372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340494
580	NC_009928	AAG	2	6	42520	42525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340494
581	NC_009928	ATC	2	6	42538	42543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340494
582	NC_009928	TA	3	6	42645	42650	50 %	50 %	0 %	0 %	158340494
583	NC_009928	TC	4	8	42700	42707	0 %	50 %	0 %	50 %	158340494
584	NC_009928	TGC	2	6	42759	42764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340494
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586	NC_009928	CT	3	6	43410	43415	0 %	50 %	0 %	50 %	158340495
587	NC_009928	TTGGAG	2	12	43768	43779	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340495
588	NC_009928	AGC	2	6	43822	43827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340495
589	NC_009928	ATA	2	6	44014	44019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340495
590	NC_009928	CAG	2	6	44040	44045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340495
591	NC_009928	CCA	2	6	44131	44136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340495
592	NC_009928	CTT	2	6	44155	44160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340495
593	NC_009928	CAC	2	6	44320	44325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340495
594	NC_009928	TCA	2	6	44333	44338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340495
595	NC_009928	AGC	2	6	44343	44348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340495
596	NC_009928	GACT	2	8	44469	44476	25 %	25 %	25 %	25 %	158340495
597	NC_009928	GGT	2	6	44635	44640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340495
598	NC_009928	CCAT	2	8	44765	44772	25 %	25 %	0 %	50 %	158340495
599	NC_009928	GCA	2	6	44778	44783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340495
600	NC_009928	AG	3	6	44788	44793	50 %	0 %	50 %	0 %	158340495
601	NC_009928	GTG	2	6	44985	44990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340495
602	NC_009928	CGC	2	6	45005	45010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340495
603	NC_009928	TCC	2	6	45217	45222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340495
604	NC_009928	ATAA	2	8	45301	45308	75 %	25 %	0 %	0 %	158340495
605	NC_009928	TGA	2	6	45403	45408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340495
606	NC_009928	GCT	3	9	45511	45519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340495
607	NC_009928	TCT	2	6	45547	45552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340495
608	NC_009928	AT	3	6	45590	45595	50 %	50 %	0 %	0 %	158340495
609	NC_009928	CGA	2	6	45632	45637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340495
610	NC_009928	TTG	2	6	45660	45665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340495
611	NC_009928	GTGGG	2	10	45725	45734	0 %	20 %	80 %	0 %	158340495
612	NC_009928	TTG	2	6	45736	45741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340495
613	NC_009928	GAGT	2	8	45783	45790	25 %	25 %	50 %	0 %	158340495
614	NC_009928	CTG	2	6	45802	45807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340495
615	NC_009928	TCA	2	6	45896	45901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340495
616	NC_009928	TGTC	2	8	45921	45928	0 %	50 %	25 %	25 %	158340495
617	NC_009928	CCA	2	6	45934	45939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340495
618	NC_009928	CAG	2	6	45970	45975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340495
619	NC_009928	GTT	2	6	46049	46054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340495
620	NC_009928	C	6	6	46109	46114	0 %	0 %	0 %	100 %	158340495
621	NC_009928	AGG	2	6	46151	46156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340495
622	NC_009928	TC	3	6	46196	46201	0 %	50 %	0 %	50 %	158340495
623	NC_009928	ACC	2	6	46309	46314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340495
624	NC_009928	CGA	2	6	46344	46349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340495
625	NC_009928	ATG	2	6	46367	46372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340495
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765	NC_009928	CAAGTC	2	12	54718	54729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340505
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878	NC_009928	TTAT	2	8	62796	62803	25 %	75 %	0 %	0 %	158340514
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